便秘时吃酵素梅是存在一定健康危害的，不建议作为常规通便方式长期或大量食用。
市面上不少主打“通便、排毒、清肠”的酵素梅，本质上并非靠宣传中的“酵素（酶）”发挥作用，而是额外添加了番泻叶、大黄、决明子等含蒽醌类成分的刺激性泻药，或是大剂量的渗透性泻剂。短期食用后，肠道受到强烈刺激，可能很快就会出现排便反应，但如果经常食用，首先会反复刺激肠道黏膜，损伤黏膜屏障，长期下来还可能导致肠道黏膜色素沉着，引发结肠黑变病，反而进一步削弱肠道正常的蠕动功能。频繁的腹泻样排便会打乱肠道内的菌群平衡，造成钾、钠等电解质流失，对于肠胃本就偏弱的人群、老人或是儿童，甚至可能引发更严重的健康隐患。
不少人觉得酵素梅吃着方便，口感也像普通零食，就长期靠它来解决排便问题，久而久之很容易产生依赖性。刺激性泻药会让肠道自身的蠕动反射逐渐变得迟钝，原本可以靠自身蠕动推送粪便的功能会逐步退化，需要不断加大食用量才能达到通便效果，形成“越吃越便秘”的恶性循环，也就是临床上常说的泻药依赖性便秘。很多人一开始吃一颗就有明显效果，后来吃三四颗都没反应，就是依赖产生的典型表现。
日常改善便秘更建议从调整生活习惯入手，多吃富含膳食纤维的全谷物、新鲜蔬果，每天保证1500-2000ml的饮水量，搭配每周3-5次的适量运动，养成晨起或餐后定时排便的习惯，不要盲目依赖各类宣称快速通便的零食类产品，以免给肠道造成不可逆的损伤。
