十二指肠溃疡最主要的症状是周期性、节律性的上腹部疼痛，也可伴随多种消化道不适，部分患者无明显症状，可因并发症发作才发现异常。
1. 典型节律性、周期性腹痛
疼痛大多出现在上腹中部偏右的位置，更有特点的就是空腹疼痛，一般在餐后2~4小时或者夜间饥饿时发作，多表现为隐痛、胀痛或是灼痛感，进食后疼痛会很快缓解。这种疼痛会周期性发作，一次发作可持续数周，之后缓解几个月，很容易在秋冬、冬春换季的时候复发。
2. 常见消化道伴随症状
除腹痛外，多数患者会伴随反酸、烧心、嗳气、腹胀的情况，部分人空腹时会出现恶心、食欲下降，少数溃疡靠近幽门的患者，进食后反而会腹胀加重。
3. 不典型表现与并发症症状
大概有10%~15%的患者平时没有明显不舒服，首发表现就是溃疡引发的并发症：比如溃疡出血会出现黑便、头晕乏力，出血量较大时还会呕血；溃疡穿孔会引发突发剧烈腹痛，腹部摸起来僵硬紧绷；如果溃疡堵塞幽门造成梗阻，会反复呕吐隔夜未消化的食物，还会伴随体重下降。