半夜小腹疼醒可能是由多种原因引起的，以下是一些常见原因：
1. 消化问题：小腹疼痛可能是由于消化系统问题引起的，如胃酸反流、胃炎、胆囊炎等。
2. 肠道问题：肠道问题，如便秘、腹泻、肠痉挛等，都可能导致小腹疼痛。
3. 维生素或矿物质缺乏：某些维生素和矿物质的缺乏也可能引起小腹疼痛，例如维生素D缺乏导致的骨质疏松症。
4. 泌尿系统问题：泌尿系统问题，如尿路感染、肾结石等，也可能引起小腹疼痛。
5. 女性生理问题：女性在月经期间或有月经问题时，也会出现小腹疼痛。
如果您遇到频繁或长时间出现小腹疼痛的情况，建议咨询医生进行详细的检查和诊断，以确定具体的原因并采取适当的治疗措施。