长时间的肠功能紊乱可能会引起一系列的健康问题，包括但不限于以下几点：
1. 腹痛和不适：肠功能紊乱可能导致腹痛、腹胀、腹泻或便秘等不适感，影响生活质量。
2. 营养不良：肠功能紊乱可能导致营养吸收减少，使身体无法充分吸收重要的营养物质，如维生素、矿物质和蛋白质等，进而导致营养不良和体重下降。
3. 消化问题：肠功能紊乱可能导致食物在肠道内停留时间过长或过短，影响消化过程，进而引发胃酸倒流、胃灼热、胃食管逆流等问题。
4. 免疫系统问题：肠道是身体的重要免疫器官之一，长期的肠功能紊乱可能导致免疫系统受损，增加感染和炎症的风险。
5. 情绪问题：肠功能紊乱可能会导致焦虑、抑郁等情绪问题，因为肠道和大脑之间有着密切的联系，肠道问题可能会影响情绪和心理状态。
6. 社交和心理困扰：长期的肠功能紊乱可能让人避免参加社交活动，造成孤立和心理困扰，影响人际关系和社会交往。
对于长期的肠功能紊乱问题，建议及时就医寻求专业的医疗建议和治疗，以减轻症状并改善生活质量。