紫菜之所以被称为黑紫菜，是因为其在生长过程中产生了大量的黑色素。黑色素是真菌类的一种物质，它会在紫菜体内形成黑色素沉着，使得紫菜呈现出黑色的外观。
紫菜生长在海洋中，其体内含有一种称为黑色素沉着藻类的真菌。当紫菜遇到适宜的环境条件时，真菌就会寄生在紫菜的细胞表面，通过其菌丝在紫菜体内形成黑色素。黑色素起到一定的保护作用，可以帮助紫菜抵御紫外线的伤害和捕捉更多的光合作用。
紫菜还含有一种名为胡萝卜素的物质，它在紫菜中也起到使其呈现紫色甚至红色的作用。所以紫菜在不同的光照条件下，有时会呈现出紫色或红色，有时会呈现出黑色。