交感神经兴奋时会整体抑制肠胃的正常消化功能，这种调节是为了给机体应对紧急情况重新分配能量，长期交感神经异常兴奋还会诱发多种肠胃病变。
1、影响肠胃平滑肌蠕动。交感神经兴奋时会降低肠胃平滑肌的紧张性，减慢收缩频率，让肠胃蠕动整体变慢变弱，延长胃排空的时间，吃进去的食物无法及时被推送往下消化，短期就会出现腹胀、食欲下降的情况，长期频繁处于交感兴奋状态，还容易引发功能性便秘，不少人压力大、紧张的时候会出现排便不畅、没胃口，就是这个原因。
2、抑制消化腺的分泌功能。交感神经会直接抑制胃酸、胰液、胆汁、肠液等各类消化液的分泌，而消化液是分解食物、促进营养吸收必需的物质，分泌量减少后肠胃的消化吸收能力会直接下降，短期会完全没食欲，长期还可能因为营养吸收不足，出现乏力、体重下降甚至营养不良的问题。
3、改变肠胃供血状态与括约肌功能。交感神经兴奋时会优先保障大脑、肌肉等应对紧急情况的核心器官供血，会主动收缩肠胃区域的血管，导致肠胃供血量减少，长期供血不足会反复损伤肠胃黏膜，增加慢性胃炎、胃溃疡的发病风险；同时交感神经兴奋会让幽门括约肌、肛门内括约肌等保持收缩状态，进一步阻碍食物消化和粪便排泄，加重肠胃功能紊乱。