肠道代谢组学是一种研究肠道微生物与宿主代谢相互作用的领域。肠道微生物是人体肠道中寄生的细菌、真菌和其他微生物的总称，它们与宿主的代谢相互作用对人体的健康和疾病具有重要影响。肠道代谢组学通过研究肠道微生物对食物成分的代谢过程，揭示肠道微生物与宿主代谢之间的相互关系。
肠道代谢组学可以通过多种技术手段来研究肠道微生物与宿主代谢的相互作用，包括16S rRNA测序、功能基因组测序、代谢组学和转录组学等。通过分析肠道微生物的遗传信息和代谢产物，可以了解肠道微生物的组成、功能和代谢活性，进而研究其与宿主代谢之间的关系。
肠道代谢组学的研究对于揭示肠道微生物与宿主代谢之间的相互作用机制、了解肠道微生物对人体健康的影响、发现新的治疗策略和预防策略等具有重要意义。目前，肠道代谢组学已经被广泛应用于研究肥胖症、糖尿病、肠道炎症、自身免疫性疾病等与肠道微生物相关的疾病。