肠道菌群是指生活在人体肠道内的微生物群落，包括细菌、真菌、病毒等。肠道菌群与代谢组学之间存在着密切的关系。
肠道菌群通过参与食物的消化、吸收和代谢，对人体营养吸收和能量代谢起着重要的调节作用。例如，益生菌可以帮助消化吸收食物中的纤维素，产生短链脂肪酸等有益物质，促进肠道蠕动，改善便秘；而某些肠道菌群也会参与胆固醇代谢，对人体的胆固醇水平有一定影响。
肠道菌群与代谢组学还通过共同参与维持肠道屏障功能、免疫调节、药物代谢等方面的作用而相互影响。肠道菌群可以参与维持肠道黏膜屏障的完整性，抑制有害菌的滋生；菌群的紊乱也可能导致肠道屏障的损伤，增加炎症反应。
代谢组学则是通过研究生物体内代谢物的组成和变化，来了解生物体的代谢状态和相关代谢途径的变化。通过对代谢物的检测和分析，可以揭示人体在不同生理状态下的代谢特征，如糖代谢、脂代谢、氨基酸代谢等。通过对代谢物的定量分析，可以评估人体的营养状况、疾病风险等。
肠道菌群与代谢组学之间的关系在健康和疾病状态下都起着重要作用。肠道菌群的紊乱可能导致代谢紊乱，进而影响人体的健康状况。一些研究表明，肠道菌群的失调与肥胖、糖尿病、心血管疾病、炎症性肠病等疾病的发生发展密切相关。通过调节肠道菌群结构，可以对人体的代谢状态产生积极影响，维护身体健康。
肠道菌群与代谢组学之间存在着紧密的相互关系，对人体的营养吸收、能量代谢和疾病发生发展等方面都具有重要影响。深入研究肠道菌群与代谢组学之间的关系，有助于揭示肠道微生物与宿主之间的相互作用机制，并为预防和治疗相关疾病提供新的策略和方法。