肠胃蠕动时发出咕咕咕的声音是正常现象，它是消化道中食物被推动、混合和消化的结果。这种声音被称为胃肠蠕动音。如果这种声音伴随着肚子疼痛，可能是由以下几种原因引起的：
1. 消化不良：消化不良是食物无法正常消化的情况，可能导致胃肠蠕动加快，引起肚子疼痛。
2. 肠道感染：肠道感染可以引起肠道蠕动增加，导致腹痛和腹泻。
3. 肠易激综合征：肠易激综合征是一种常见的肠道功能紊乱，其中肠道蠕动异常，可能导致腹痛和胀气。
4. 胃炎或胃溃疡：胃炎或胃溃疡可能导致胃部疼痛，并引起胃肠蠕动音增加。
如果您经常出现这种情况，建议就医咨询医生以获得准确的诊断和治疗建议。