原始饮食肠道菌群是指古代人类以及其他古代哺乳动物所拥有的肠道微生物群落。原始饮食肠道菌群与现代人类的肠道菌群有所不同，主要原因是现代人类的饮食结构和生活方式的改变。原始饮食肠道菌群主要以纤维素消化产生的短链脂肪酸为能源来源，有助于肠道健康和免疫系统的正常发挥作用。
原始饮食肠道菌群的特点包括多样性较高、富含益生菌、能够更好地降解纤维素和其他复杂的多糖类物质。而现代人类的肠道菌群常受到高脂肪、高糖分、加工食品和抗生素的影响，导致菌群的多样性降低、益生菌数量减少、有益菌数量增加。
一些研究表明，原始饮食肠道菌群与健康状况密切相关。现代人类常见的一些肠道疾病，如肠道炎症、自身免疫性疾病、肥胖症等，与肠道菌群的紊乱有关。有些人认为通过改变饮食结构，采用更接近原始饮食的方式，可以调整肠道菌群，改善健康状况。但目前对于原始饮食肠道菌群与健康之间的关系还需要更多的研究来证实。