小孩肠胃不好的检查方法主要有以下几种：
1. 体格检查：包括观察小孩是否有腹痛、腹胀、恶心、呕吐、食欲不振等症状，以及观察小孩的体重、身高等生长发育情况。
2. 血液检查：进行血常规、电解质、肝功能、胰岛素等方面的检查，以了解是否有炎症、感染、电解质紊乱等问题。
3. 粪便检查：包括常规粪便检查、纳米线检测、寄生虫检查等，以了解是否有消化道感染、寄生虫感染等问题。
4. 小肠吸收功能检查：如乳糖耐受试验、蔗糖水吸收试验等，以评估小肠对某些物质的吸收情况。
5. 腹部超声检查：通过超声波来观察小孩的腹腔器官，如肝脏、胰腺、肾脏等，以了解是否有肿块、囊肿、结石等问题。
6. 消化道内窥镜检查：通过将柔软的管状器械插入小孩的口腔或肛门，进入消化道内部进行观察，以了解消化道黏膜是否有问题。
以上仅为常见的一些检查方法，实际的检查方案应根据具体病情和医生的意见来确定。建议家长在发现小孩肠胃不好的情况时及时就医，并按医生的指导进行相关检查。