由于男女菌群存在差异，不合适的性生活可能会导致一些健康问题。例如，女性的阴道中存在着乳酸杆菌和其他有益菌群，它们能够维持阴道的酸碱度平衡、抑制有害细菌的生长，防止感染。如果性生活时使用了带有化学成分的润滑剂或者没有使用安全套导致男性带有有害细菌和病毒，这些致病菌可能侵入女性的生殖道，破坏了阴道环境平衡，导致阴道感染等健康问题。
如果双方在性生活前没有进行清洁，会增加对方感染的风险。如果双方存在性传播疾病（STD）或细菌感染，性行为会使之传播给对方，从而造成健康危害。
为了保持良好的健康状况，建议在性生活中注意个人卫生和使用安全套保护自己和对方。如果出现不适症状，应及时就医。