肠道菌群与自身免疫性疾病之间存在着密切的关系。自身免疫性疾病是指人体免疫系统错误地攻击自己的组织和器官，导致疾病发生。近年来的研究发现，肠道菌群的失衡会影响人体的免疫系统，从而可能导致自身免疫性疾病的发生。
例如，炎症性肠病（IBD）是一种常见的自身免疫性疾病，包括溃疡性结肠炎和克罗恩病。许多研究表明，肠道菌群的改变与IBD的发生和发展有关，其中某些菌群的过度生长可能导致肠道炎症和免疫系统失调。
多发性硬化症（MS）也是一种自身免疫性疾病，会导致神经系统受损。研究表明，肠道菌群的失衡可能影响MS的发生和发展。例如，某些菌群的生长会导致免疫细胞攻击神经系统，从而导致MS的发生。
肠道菌群的失衡可能与自身免疫性疾病的发生和发展有关。保持肠道菌群的平衡和健康可能有助于预防和治疗这些疾病。