肠道菌群主要包括以下种类的菌群：
1. 双歧杆菌和乳酸菌：这些菌是益生菌，有助于保持肠道健康，并能促进免疫系统的功能。
2. 短链脂肪酸菌（例如：丙酸菌、乙酸菌和丁酸菌）：这些菌能够利用未被消化的食物残渣，产生短链脂肪酸，有助于减少肠道炎症和提高肠道屏障功能。
3. 纤维素分解菌：这些菌能够分解纤维素，有助于保持肠道正常的功能，并促进食物的消化和吸收。
4. 硫酸盐还原菌：这些菌能够还原硫酸盐，生成硫化物和氢气，并有助于预防肠道的疏松和过敏反应。
5. 葡萄球菌和大肠杆菌：这些菌是肠道微生物群体的常见成员，有助于消化和吸收营养物质，但过多或变异会引发肠道炎症和感染。