菌落呈脐窝状的细菌通常是属于革兰氏阳性菌中的一个亚门——产球菌目（Staphylococcales）。其中最常见的是金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus），它是一种常见的人体表面共生菌，在皮肤和鼻黏膜中都有分布。其他也有产脐菌属（Staphylococcus epidermidis）、淋球菌属（Staphylococcus saprophyticus）等。这些菌落呈脐窝状的特征是由它们的细胞分裂方式决定的，它们通过产生分泌物和聚集在一起形成类似于葡萄的结构，俗称为“球状菌”。这种特殊的菌落形态在鉴定细菌时具有重要意义。