肠功能紊乱导致的便便没有统一的标准形态，大多会以腹泻型、便秘型、腹泻便秘交替型三种状态呈现，还会伴随排便习惯的改变。
1. 腹泻型肠功能紊乱的便便：每天排便次数会明显增加，一般一天排便3次以上，便便多是不成形的稀糊状或者水样，大多会混着未完全消化的食物残渣，基本不会出现脓血，多数人排便前会有腹痛、肚子发胀的情况，排便后不适感会明显缓解。
2. 便秘型肠功能紊乱的便便：排便频率明显降低，通常一周排便不到3次，便便干硬结块，常呈现羊粪蛋状，排便时需要用力屏气，排完后也总有没排干净的坠胀感，部分人干硬的便便表面会附着少量透明粘液。
3. 腹泻便秘交替型肠功能紊乱的便便：这是肠功能紊乱比较典型的一种表现，便便性状会不固定，一段时间持续排稀软不成形的便，一段时间又转为干硬难排的便秘便，两种状态反复轮换，大多还会同时伴随经常放屁、肚子隐隐发胀的情况。