单纯的肠胃功能性紊乱一般不会拉黑便，仅少数特殊情况才会出现黑便表现。
1 肠胃功能性紊乱属于功能性疾病，本质是肠胃运动、调节功能失常，并没有消化道黏膜破损、器质性出血这类问题，而黑便最常见的成因就是消化道出血（血液中的血红蛋白会和肠道内的硫化物结合形成黑色的硫化亚铁，改变粪便颜色），因此不合并其他问题的单纯功能性紊乱，基本不会出现黑便，它的常见症状还是腹痛、腹胀、排便习惯改变这些。
2 少数情况下，肠胃功能性紊乱长期反复发作，比如持续便秘、频繁剧烈腹泻，会反复刺激肠道黏膜，如果本身就有微小黏膜糜烂、痔疮这类基础问题，就可能引发少量消化道出血，出血量少的时候就会表现为黑便，这种情况其实是合并了黏膜损伤出血，并非单纯功能紊乱直接导致的。
3 生活中不少人出现黑便后会误以为是功能紊乱导致，其实大多是饮食或药物因素造成的：比如近期吃了动物血、大量黑芝麻这类食物，或是服用了补铁剂、治疗胃病的铋剂，都会让粪便变黑，这种情况刚好赶在功能紊乱发作期，就很容易混淆原因。