只有特定细菌感染引起的拉肚子，庆大霉素才可以起到治疗作用，它并不是适用于所有类型拉肚子的万能药。
1. 庆大霉素属于氨基糖苷类抗生素，仅对细菌感染引发的拉肚子有效。比如误食被大肠杆菌、沙门氏菌等有害菌污染的食物引发的急性肠道感染腹泻，口服庆大霉素可以直接在肠道局部作用杀灭致病菌，从而缓解拉肚子的症状。
2. 绝大多数常见拉肚子都不能用庆大霉素治疗。比如轮状病毒、诺如病毒感染引发的秋季腹泻、急性肠胃炎腹泻，还有受凉、消化不良、食物过敏、肠易激综合征等非感染性因素引发的拉肚子，庆大霉素对这些情况完全没有治疗效果，盲目用药反而会杀死肠道有益菌，破坏肠道菌群平衡，还可能催生耐药菌。
3. 庆大霉素存在明确的耳毒性、肾毒性副作用，儿童、yun妇、肝肾功能不全的人群一定要禁用，即便符合适应症也不能自行随意使用，需要遵医嘱判断用量和用药时长，目前临床一般也不会将庆大霉素作为肠道感染腹泻的优选治疗药物。