大部分症状较轻、病程较短的胃神经官能症可以自愈，中重度、病程较长、伴随明显精神心理问题的胃神经官能症通常无法自愈，需要规范干预才能缓解。
1. 能自愈的情况大多是暂时性的功能紊乱，一般发作时间短，只是偶尔出现胃胀、嗳气、反酸这类轻微不适，诱因也很明确，比如最近连续熬夜、赶项目压力大、一段时间饮食不规律，只要及时切断这些诱因，规律吃饭睡觉，慢慢把情绪放松下来，植物神经就能自己调整回正常状态，症状也就慢慢消失了。
2. 没办法自愈的情况基本都存在根深蒂固的紊乱，要么病程已经拖了好几个月甚至更久，症状反复出现，还伴随明显的焦虑、抑郁、长期失眠这类问题，要么本身就是敏感多疑、压力承受力弱的体质，这种情况植物神经的紊乱已经形成了惯性，单纯靠身体自我调节很难纠正，放任不管不仅症状不会消，还可能因为长期不适反过来加重情绪问题，进入恶性循环。
3. 不管能不能自愈，都要采取正确的应对方式，轻度患者可以先调整生活方式观察，比如少吃辛辣生冷的刺激性食物，每天抽半小时运动，多通过社交、爱好疏解压力，如果调整1-2个月症状还是没有缓解，或者一开始症状就比较重，一定要及时就医，规范用调节神经、改善情绪的药物干预，大多都能很好的控制病情。