小孩长期反复便秘大多是日常饮食、排便习惯不良引发的功能性便秘，少数是肠道发育异常、食物过敏等器质性问题导致的。
1. 饮食习惯不合理是最常见的原因。很多家长给孩子吃的过于精细，顿顿都是白米白面、肉蛋类，全谷物、带纤维的蔬菜水果吃得太少，肠道缺少足够的膳食纤维刺激蠕动，就容易攒便。还有不少孩子不爱喝水，或者家长给孩子过量补钙、喂浓度过高的配方奶，都会让大便变得干硬难以排出，反复出现便秘。
2. 没养成良好的排便习惯形成恶性循环。很多孩子小时候会因为贪玩憋便，或是刚入园、入学不习惯在外排便，硬生生把便意憋回去，时间长了大便在肠道里停留太久，水分被反复吸收就越来越干，排便时还会撑得肛门疼出血，孩子就更抗拒排便，形成“憋便-便干-更不敢拉”的循环，便秘就一直好不了。
3. 病理因素影响也会导致便秘反复。少数孩子的便秘是天生肠道发育异常导致的，比如先天性巨结肠、乙状结肠冗长，还有些孩子是对牛奶蛋白、麸质等食物过敏，或是存在甲状腺功能减退这类基础病，都会影响肠道正常蠕动，让便秘一直反复，这类情况通常还会伴随生长发育落后、频繁腹胀呕吐等其他异常表现。