肠子颤动大多是肠道蠕动加快或蠕动节律异常引发的，多数是生理性正常表现，少数由肠胃疾病导致。
1. 生理性蠕动加快，这是最常见的诱因。比如长时间空腹饥饿、吃了生冷辛辣等刺激性食物、吃饭狼吞虎咽吞入太多空气，或是精神过度紧张焦虑的时候，都会让肠道蠕动速度明显变快，进而出现能感知到的肠子颤动，这种情况一般短时间就能自行缓解，不会频繁发作。
2. 肠道功能紊乱或肠易激综合征，这是病理性肠子颤动最常见的原因。长期饮食不规律、精神压力大，很容易打乱肠道正常的收缩蠕动节律，引发肠道异常蠕动，频繁出现肠子颤动的感觉，通常还会伴随腹胀、腹痛、排便不成形，或是便秘腹泻交替的情况。
3. 炎症或其他器质性病变刺激，吃了不干净的食物引发急性肠胃炎时，细菌、病毒产生的炎症会持续刺激肠道，让肠道蠕动亢进，出现肠子颤动，还会同时伴随腹痛、腹泻、恶心呕吐；另外肠道息肉、**、早期肠梗阻等问题，也会因为刺激肠道异常收缩，频繁出现肠子颤动，这类情况一般还会伴随便血、体重下降、排气排便异常等明显异常信号。