小金鲳鱼只要按步骤去除表层鱼鳞、鱼鳃、内脏以及腹腔内的腥源，就能处理得干净无异味。
1、刮净鱼鳞和表层粘液。小金鲳的鱼鳞细密紧贴鱼皮，先把鱼身打湿，用刀背或者干净的不锈钢汤匙背面，从鱼尾逆着鱼鳞生长方向往鱼头刮，鱼肚子部位皮肤偏软，刮的时候控制好力度，避免刮破鱼皮，整鱼刮完后用清水冲掉鳞渣，顺带冲掉鱼身表层的滑腻粘液。
2、完整取出鱼鳃和内脏。在小金鲳的鳃盖下方横切出1厘米左右的小口，先把两侧的鱼鳃抠除干净，再把手指从切口伸进去，贴着鱼腹内壁把整块内脏慢慢掏出来，尽量不要弄破苦胆，如果不小心弄破，立刻用干面粉搓抹染了胆汁的部位，冲净后就能去除苦味。
3、清理腥源最后泡洗。掏完内脏后，鱼腹内壁的黑膜和脊骨处的贴骨血是主要的腥味来源，要用刀把黑膜完全刮掉、淤血刮干净，之后把整鱼放到加了一勺食盐和少许料酒的清水中，浸泡10分钟泡出残余血水，最后用流动清水冲洗一遍就处理完成了。