其实健康人体的肠道本来就存在数量庞大的菌群，不需要刻意减少菌群总量，只要调整菌群结构、维持有益菌占优势的平衡状态就能保障肠道健康，只有因有害菌过度增殖引发病理问题时才需要针对性干预。
1. 先确认是否需要干预。大部分人对“肠道菌群多”都存在错误认知，如果本身没有长期腹痛、腹泻、便秘、消化不良或者体重异常波动这类不适，常规检查也没提示肠道异常，完全不需要特殊处理，保持正常的生活习惯就好；如果有明确不适，或是已经检查确诊小肠细菌过度生长、严重菌群失调，再进行针对性干预即可。
2. 通过日常饮食调整菌群结构。日常要减少高糖、高脂、腌制类加工食物的摄入，这类食物会助长有害菌繁殖；多吃燕麦、糙米、新鲜蔬果、菌菇类等富含膳食纤维的食物，给肠道有益菌提供养分，也可以适量吃无糖原味酸奶、纳豆、泡菜这类天然发酵食物，帮助优化菌群结构。
3. 病理情况遵医嘱规范处理。如果已经确诊有害菌过度增殖引发了肠道问题，要按照医生的方案针对性用药控制过度增殖的有害菌，后续再配合使用益生菌、益生元重建肠道菌群平衡，不要自行滥用抗生素或者刺激性通便产品，避免进一步破坏肠道菌群的稳定。