黑鱼和草鱼在干净程度上的比较，主要取决于它们的生存环境和生活习性。
黑鱼属于底栖性鱼类，常栖息于水草丛生、底泥细软的静水或微流水中，有时会在泥沙中蛰伏。这种生活环境可能导致黑鱼身上容易附着泥沙和污物。黑鱼本身是可以食用的，只要在烹饪前进行充分的清洗和处理，是可以确保卫生的。
草鱼则主要栖息于平原地区的江河湖泊，一般喜居于水的中下层和近岸多水草区域。相比黑鱼，草鱼的生活环境可能更为开阔和清洁，因此从生存环境来看，草鱼可能相对更干净一些。草鱼是典型的草食性鱼类，其食物来源相对单一且较为清洁，这也可能有助于保持其身体的相对清洁。
虽然黑鱼和草鱼在生存环境和生活习性上存在差异，但只要经过适当的清洗和处理，它们都是可以安全食用的。在比较两者的干净程度时，草鱼可能因其生活环境和食物来源而相对更干净一些。但这并不意味着黑鱼就不干净或不能食用，关键在于烹饪前的清洗和处理过程。