1. 对于肠道菌群失调较轻的情况，例如短暂性肠道菌群失调，如婴幼儿急性腹泻、消化不良引起的腹泻、便秘等症状，一般服用双歧杆菌2\~3天就会有明显的效果。
2. 如果肠道菌群失调较为严重，需要长期服用抗生素的患者，应用双歧杆菌的时间可能会更长。例如，抗生素相关性肠道菌群失调的患者，在服用抗生素期间出现的腹泻，临床可服用双歧杆菌类益生菌药物，一般7\~10天左右，有助于改善肠道功能。若抗生素使用周期较长，则双歧杆菌使用时间应酌情延长。
3. 对于老年人，由于新陈代谢较慢和肠道菌群恢复较慢，双歧杆菌的服用时间可能需要1\~3个月，甚至更长时间。
临床用药听从医生的医嘱，切不可自行盲目乱用，以免延误或加重病情。患者在日常生活中还应注意饮食的营养均衡，多摄入新鲜蔬菜及水果，这有助于肠道菌群的恢复。