肠胃型感冒是柯萨奇等病毒感染为主，结合免疫力下降、腹部受凉、饮食不当等诱因共同作用导致的。
1、核心病因是病毒感染。最常见的致病病毒是柯萨奇病毒，此外还可能合并腺病毒、埃可病毒等感染，这些病毒大多通过呼吸道飞沫入侵人体，繁殖过程中不仅会引发咽痛、鼻塞这类上呼吸道症状，还会侵袭胃肠道黏膜，导致肠胃蠕动紊乱、黏膜水肿，最终引发呕吐、腹泻、腹痛这类肠胃不适，少部分也可通过食用被病毒污染的水或食物直接感染发病。
2、免疫力下降是主要的发病基础。如果近期存在过度劳累、熬夜、淋雨，或者本身患有慢性基础病、长期缺乏运动，都会导致全身免疫力短期下降，无法及时清除入侵的病毒，给病毒繁殖发病创造了条件。
3、不良生活习惯会直接诱发症状发作。很多人感染病毒后初期没有明显症状，但若一次性吃太多生冷、辛辣、油腻的刺激性食物，或者长期饮食不规律、腹部保暖不到位反复受凉，都会进一步降低肠胃的抵抗力，刺激肠胃黏膜，让原本隐匿的感染快速发展出明显症状。