轻中度功能性胃肠病可以通过科学的生活方式调整实现自愈，重度功能性胃肠病无法自愈，需要配合规范的临床干预改善症状。
1 调整情绪与压力状态。功能性胃肠病的发作和情绪波动、长期压力焦虑高度相关，大部分患者调整好情绪后症状就能缓解大半。日常要避免长期陷入过度思虑、焦虑的状态，每天可以留30分钟左右的放松时间，做点能让自己分心开心的事，比如散步、养花、听轻音乐，压力大的时候及时把烦心事说给亲友倾诉，不要长期闷在心里，尽量保持情绪平稳。
2 纠正饮食和作息习惯。避开自己明确吃了就不舒服的食物，比如不少人吃冰饮、辛辣食物、乳制品后会腹痛腹胀，就要主动忌口；日常吃饭要定时定量，不要饥一顿饱一顿，也不要暴饮暴食、过度节食，尽量少吃重油重盐的外卖和高糖加工零食，多吃新鲜好消化的食物；作息尽量规律，不要长期熬夜，尽量保证每天7-8小时的睡眠时间，慢慢养好肠胃的生物钟。
3 坚持温和规律的运动。长期久坐不动会加重肠胃蠕动紊乱，日常饭后不要立刻平躺久坐，可以起身站一站或者慢走10-15分钟；每周保持3-5次温和的运动，比如快走、打太极、瑜伽、慢跑，既能促进肠胃蠕动，也能帮着舒缓压力，不要一开始就做高强度剧烈运动，坚持一段时间肠胃功能就能慢慢恢复稳定。