同时出现耳鸣、肠鸣，大多是植物神经功能紊乱引发，也可见于不同部位疾病合并发作，少数和全身性基础疾病有关。
1. 植物神经功能紊乱，这是两类症状同时出现最常见的原因。长期压力大、情绪焦虑紧张、熬夜作息不规律，都会打乱调控内脏、血管的植物神经节律，既会影响内耳的微循环供血，引发神经性耳鸣，也会导致肠胃蠕动功能紊乱，肠胃蠕动异常加快就会出现明显肠鸣，不少伴随失眠、心慌、消化不良的患者，基本都是这个原因。
2. 两类独立疾病合并发作，就是本身刚好有耳部疾病和消化道问题，赶在同一时间段发作。比如本身有中耳炎、梅尼埃病、神经性耳鸣等耳部基础问题，同时又吃了生冷刺激食物引发急性肠胃炎，或是本身有肠易激综合征、功能性消化不良，肠胃蠕动异常亢进而产生肠鸣，两种无关的疾病刚好凑在一起，就表现为同时出现耳鸣和肠鸣。
3. 全身性基础疾病影响，部分代谢类、循环类疾病会同时影响耳部和肠胃功能。比如糖尿病会损伤全身的微血管和末梢神经，内耳微血管、肠胃自主神经受损后，就会同时引发耳鸣和肠鸣；甲状腺功能亢进会加快全身代谢速率，不仅会让神经兴奋性升高引发耳鸣，也会加快肠胃蠕动导致肠鸣频发；贫血、低血压等问题导致全身供血不足，内耳和肠胃得不到足够血氧供给，也会同时出现两类症状。