肠道紊乱通过科学的饮食调整、生活习惯改善、情绪调节配合必要的医疗干预，大多可以得到有效控制并逐步恢复稳定。
1 调整日常饮食结构，保持规律进食。日常要避开生冷辛辣、高油高脂的刺激性食物，少喝浓茶、酒精类饮品，容易胀气腹泻的人要少吃豆类、过量乳制品、甜腻蛋糕这类可能加重不适的食物；尽量做到三餐定时定量，不要饿一顿饱一顿，也不要经常吃深夜夜宵；平时可以适当吃点无添加糖的原味酸奶、纳豆这类发酵食物，帮助调节肠道菌群，不要盲目吃各种网红清肠排毒产品，反而会损伤肠道自主调节功能。
2 纠正不良作息，调节情绪状态。长期熬夜、久坐不动都会打乱肠道正常蠕动节律，尽量保持固定的作息，每天抽30分钟左右散散步、慢跑或者做做瑜伽，既能促进肠胃蠕动，也能帮着舒缓压力；还可以试着养成固定时间排便的习惯，慢慢帮肠道建立规律的反射；大部分功能性肠道紊乱都和情绪压力直接相关，长期焦虑、憋闷会明显影响肠道功能，平时要注意及时疏解情绪，通过爱好、社交转移注意力，减少负面情绪对肠道的影响。
3 遵医嘱进行规范的医学干预。如果调整生活半个月以上还是频繁出现腹痛、腹泻便秘交替的情况，要及时去医院检查，排除炎症、息肉等器质性病变；确诊功能性肠道紊乱后，要按照医嘱针对性用药，比如腹泻明显的用止泻、调节肠道动力的药物，便秘的用温和的促排便药物，不要自己随意吃抗生素或者强效泻药，避免反而加重肠道菌群失衡，让紊乱更难恢复。