肠功能紊乱和慢性结肠炎都是肠道问题，但是两者有一些明显的不同点。
肠功能紊乱是指肠道在没有明显的器质性病变的情况下，经常出现腹泻、便秘、腹痛、消化不良等症状。其症状通常不会导致肠道结构和组织的改变，通常不会出现炎症、溃疡和出血等问题。肠功能紊乱的原因可能是膳食、压力、药物或慢性疾病等因素引起的肠道不适。
慢性结肠炎是一种慢性炎症性肠病（IBD），这种肠病会导致肠道发炎和溃疡形成。慢性结肠炎通常分为两种类型：溃疡性结肠炎和克罗恩病。溃疡性结肠炎主要影响结肠，其中包括直肠和乙状结肠，而克罗恩病可以影响消化道的任何一部分，从口腔到肛门。慢性结肠炎的症状包括腹泻、腹痛、便秘、贫血、体重下降等，严重的情况下还会出现瘘管、肠狭窄和肠穿孔等严重并发症。
肠功能紊乱和慢性结肠炎之间的区别在于前者不会造成明显的肠道结构和组织的改变，症状多为轻度，而后者则会导致炎症和组织的损害，症状比较严重，需要进行细致的治疗。