肠道菌群不具备的生理功能包括：
1. 吸收营养物质：肠道菌群主要生活在肠道中，不参与消化和吸收营养物质的过程。
2. 分解纤维：肠道菌群可以帮助人体分解某些纤维素类物质，但并不具备完全分解所有纤维素的能力。
3. 消化蛋白质：肠道菌群并不消化蛋白质，而是依赖于人体消化系统中的酶来完成蛋白质的消化。
4. 合成维生素：肠道菌群可以合成一部分维生素，如维生素K和维生素B12，但不能合成所有人体所需的维生素。
5. 分解药物：肠道菌群有能力分解某些药物，但并不具备完全分解所有药物的能力，有些药物需要经过肝脏等器官的代谢才能完全分解。
肠道菌群在人体内起到很重要的生态平衡调节作用，但并不具备所有消化和吸收营养物质的功能，还需要依赖于人体其他器官的协助完成。