结肠直肠感染的主要细菌有：
1. 大肠埃希菌（Escherichia coli）：是引起结肠直肠感染最常见的细菌之一。它可以通过食物、饮水或接触感染的物品传播。
2. 沙门菌（Salmonella）：是另一种常见的引起结肠直肠感染的细菌。它主要通过食物中的污染或与被感染人或动物接触传播。
3. 铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）：是一种常见的医院获得性感染的细菌，也可以引起结肠直肠感染。
4. 肠球菌（Enterococcus faecalis）：是一种常见的引起尿路感染和结肠直肠感染的细菌。
5. 腺病毒（Adenovirus）：虽然不是细菌，但腺病毒感染也是结肠直肠感染的常见原因之一。腺病毒感染通常通过飞沫传播。
6. 铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）：是一种常见的医院获得性感染的细菌，也可以引起结肠直肠感染。
这只是一些常见的细菌之一，还有其他细菌也可以引起结肠直肠感染。如果怀疑感染，请及时就医，并根据医生的建议进行治疗。