益生菌通常是被认为有益于肠道健康的微生物。个体对益生菌的反应是个人化的，有些人可能对摄入益生菌后出现肚子隐隐作痛的不适感。
这种不适感可能是因为：
1. 益生菌引起肠道气体产生：益生菌在肠道中生长繁殖，可能会产生气体，导致腹胀和不适感。
2. 益生菌引起肠道运动增加：益生菌在肠道中的存在可以促进肠道运动，有些人可能会对这种增加的动力活动感到不适。
3. 益生菌引起微生物平衡的变化：当增加益生菌摄入时，可能会导致肠道微生物群落的变化。这种变化可能会引起短期的不适感，通常会在一段时间内逐渐减轻。
如果肚子隐隐作痛是轻微的，并且没有其他严重的症状，那么通常是正常的反应，可以等待一段时间观察。如果症状持续加剧或伴有其他严重症状，建议咨询医生以获取更专业的建议。