肠道菌群来源主要包括以下几个方面：
1. 母亲传递：从胎儿发育早期开始，母亲的肠道菌群可以通过胎盘、羊水和母乳等途径传递给胎儿和新生儿。
2. 生殖道传递：胎儿在经过生产过程中，会暴露在母亲的生殖道中的菌群。这些菌群有可能成为胎儿的首批肠道菌群。
3. 外部环境接触：新生儿在出生后，通过与外部环境接触，会逐渐接触到更多的微生物。尤其是接触到母亲、家人和家居环境中的微生物。
4. 饮食摄入：随着婴儿逐渐转变为固体食物，食物中的微生物也成为肠道菌群的来源之一。各种食物中含有不同类型的菌群，可以丰富肠道菌群的多样性。
5. 药物干预：一些药物，尤其是抗生素，会对肠道菌群产生影响。抗生素的使用可以杀死一部分有益菌群，从而改变肠道菌群的组成。
肠道菌群的来源是多样的，早期的母婴相互传递是其中最重要的途径。而后，外部环境、饮食和药物等因素也会对肠道菌群的组成产生影响。