研究表明，在肥胖人群和健康人群中，肠道中的细菌群落存在明显差异。一些研究表明，瘦子肠道中的细菌群落更加多样化且种类更丰富，在某种程度上可以帮助维持身体的代谢健康，而肥胖人群肠道中的细菌偏向于寡种、低多样性。一些研究人员尝试通过修改人体肠道的微生态环境来治疗肥胖症。
实验显示，将健康人群肠道中的微生物移植到肥胖人群的肠道中，可以显著改善肥胖人群的代谢情况。还有一些研究表明，通过摄入特定种类的益生菌或食用富含益生元的食物，可以改善肠道微生态平衡，从而有效预防和治疗肥胖症。
虽然肠道微生态环境对肥胖症的影响尚需进一步研究，但肠道菌群调节作为一种新型的治疗手段，有望成为肥胖症治疗的重要方向之一。