长期食用消化酶可能会产生以下的害处：
1. 减弱消化功能：长期食用消化酶可能导致胃肠道对食物的消化和吸收能力降低，使食物不能得到充分消化和吸收，导致营养不良、体重下降等问题。
2. 消化不良：消化酶可能会破坏胃肠道内菌群的平衡，导致消化不良、腹泻等问题。
3. 肝肾损害：消化酶可能含有激素类物质或其他有害物质，长期使用可能对肝肾造成损伤。
4. 过敏反应：长期食用消化酶可能会导致过敏反应，表现为皮肤瘙痒、呼吸困难等。
建议在医生或药师的指导下使用消化酶，遵循药品说明书的使用方法和剂量，同时注意饮食、生活习惯的调整，以改善胃肠道健康。