只有符合医疗指征的规范洗肠才有正向价值，健康人群为了清肠排毒、养生减肥主动洗肠基本没有益处，反而会带来诸多健康风险，整体弊远大于利。
1 符合医学要求的洗肠存在明确的正向作用：术前或检查前的规范洗肠可以清空肠道内容物，让肠镜检查视野更清晰，也能保障肠道手术顺利进行；另外针对严重便秘、粪块堵塞引发的肠梗阻，以及经口摄入有毒物质的情况，洗肠还可以帮助排出粪便、清除毒物，快速缓解不适症状。
2 盲目洗肠首先会破坏肠道自身的稳定环境：健康的肠道本身有自主蠕动排便的规律，也有平衡的益生菌群维持消化免疫功能，不当洗肠会一并冲走有益菌，打乱肠道蠕动节奏，反而容易引发习惯性便秘、消化吸收紊乱，还会因为菌群失衡增加腹泻、过敏的发生概率。
3 不当操作还可能引发严重的器质性损伤：如果洗肠操作不规范，液体压力控制不当，很容易划伤肠道黏膜，甚至引发肠道穿孔、腹腔感染；频繁洗肠还会降低肛门括约肌的敏感度，导致自主排便反射减弱，本身有痔疮、溃疡性结肠炎等肠道基础病的人，洗肠还会加重原有病情。