目前并没有科学依据证明存在绝对不能和豆芽一起吃的食物，民间流传的各类“豆芽相克”说法大多是没有依据的谣言，只有特殊体质人群吃部分搭配后可能出现身体不适，需要适当注意。
1，脾胃虚寒人群不适合过量搭配寒性食物。豆芽本身性偏凉，要是本身就经常胃痛拉肚子的人，一次性同时吃大量冰奶茶、冰西瓜、苦瓜这类寒性食物，容易加重肠胃刺激，引发腹痛腹泻，普通体质的人正常量吃完全不会有问题。
2，要避免和变质未洗净的食物搭配。豆芽水分含量高，本身容易滋生细菌变质，如果搭配的肉类、卤菜、海鲜本身也没处理干净，或者已经变质，吃了之后出现的肠胃不适，其实是不洁食物本身导致的，并不是食物相克，正常干净的食物和豆芽搭配都安全。
3，痛风或嘌呤代谢异常人群不适合搭配大量高嘌呤食物。豆芽本身含有一定量的嘌呤，如果同时食用大量海鲜、动物内脏、熬煮很久的浓肉汤这类高嘌呤食物，可能会导致体内尿酸快速升高，诱发痛风发作，健康人群正常吃这类搭配没有影响。