菌群失衡有可能会引发呕吐。
1. 多数引发呕吐的情况都来自胃肠道菌群失衡，当有害菌在胃肠道中过量繁殖，会产生大量毒素刺激胃肠黏膜，还会打乱胃肠道原本规律的收缩蠕动节奏，引发胃肠道逆蠕动，进而就会出现呕吐症状，一般还会同时伴随腹胀、腹痛、腹泻或便秘等连带不适。
2. 胃部菌群失衡也会直接诱发呕吐，最常见的就是幽门螺杆菌过度增殖引发的胃部菌群紊乱，这种情况会反复损伤胃黏膜，诱发慢性胃炎、胃溃疡等问题，导致胃消化能力下降、胃排空速度变慢，食物长时间堆积在胃内，就容易出现恶心呕吐，这类不适大多出现在进食后。
3. 严重的特殊类型菌群失衡也会伴随呕吐症状，比如长期大剂量使用抗生素后引发的重度菌群失调，可能诱发伪膜性肠炎，这种病症除了会出现剧烈腹泻，还会因为肠道严重炎症反应引发全身性不适，进而出现恶心呕吐、发热等症状。