胃肠功能紊乱的恢复需要多方面的调理，包括精神、心理、饮食、运动和药物等方面。
1. 精神、心理方面：要调整情志，保持开朗、乐观的精神状态，不可过度忧思、恼怒，尽量避免紧张的状态。因为胃肠功能紊乱与心理压力大、情绪不佳有很大关系，所以心理治疗也很重要。
2. 饮食方面：控制饮食，定时定量，避免过饥过饱。忌辛辣刺激性食物，注意饮食卫生，避免诱发因素。应选用易消化、少脂肪的食物，禁食刺激性、敏感性食物。例如，平时少吃产气的食物，比如牛奶、土豆、豆类等，以免导致肠胃功能紊乱症状更加严重。以腹泻为主的患者应少吃膳食纤维丰富的食物，而便秘、腹胀者可适当多吃膳食纤维丰富但不易产气的食物。
3. 运动保健方面：加强体育锻炼，增强体质，提高机体的防御能力。适当的运动如养生气功、游泳、散步、保健操等对胃肠功能紊乱的调理有重要意义。
4. 药物调理方面：若症状比较重或持续较长时间者，可根据病情选用适当的药物。例如，可应用镇静剂如利眠宁、安定等以调节神经功能，改善睡眠；解痉止痛药如阿托品、癫茄片等可缓解腹痛症状；维生素B6可用于神经性呕吐；吗丁啉等促进胃动力的药物可促进胃肠蠕动，缓解腹部饱胀、疼痛等不适感。还可应用抗抑郁药如盐酸氟西汀以缓解精神异常。
胃肠功能紊乱的恢复需要多方面的综合调理，患者应根据自身情况选择合适的方法进行治疗和调理。保持良好的生活习惯和心态对胃肠功能紊乱的恢复也有很大的帮助。