肠胃不好可能是由于肠道菌群失调导致的，可以检查以下菌群：
1. 脂肪酸检测：通过测量粪便中的短链脂肪酸含量，评估肠道菌群的代谢情况。
2. 气体检测：通过测量氢气和甲烷气体的浓度，评估肠道菌群的产气情况。
3. 致病菌检测：检查粪便中是否存在致病菌，如大肠杆菌、沙门氏菌等。
4. 嗜酸乳杆菌检测：检查粪便中嗜酸乳杆菌的数量，嗜酸乳杆菌是一种有益菌，能够维持肠道健康。
5. 菌群测序：通过测量肠道中不同菌群的数量和种类，评估肠道菌群的整体组成及平衡情况。
需要根据具体情况，与医生进行详细讨论和诊断，选择合适的检测方法。