长期便秘本身既可以是独立的功能性消化系统疾病，也可能是消化系统器质性病变、全身性疾病或药物因素引发的临床表现。
1. 最常见的情况是功能性便秘，这本身就是一种独立的功能性肠病，肠道没有明确的结构或器质性异常，大多和长期不良生活习惯有关，比如日常饮食膳食纤维太少、喝水不足、长期久坐不动、习惯憋便、长期精神压力大等，会导致结肠蠕动减慢或者排便时盆底肌肉协调功能紊乱，症状持续超过6个月就属于长期的功能性便秘，是临床上长期便秘最常见的类型。
2. 消化系统器质性病变引发的长期便秘，这种情况里便秘是原发病的典型症状，比如结直肠**、结肠狭窄、严重痔疮肛裂、肠道憩室病、先天性巨结肠等，要么肠腔被病变占据堵塞，粪便通行受阻，要么排便时疼痛明显，让人下意识抑制便意，久而久之就形成长期便秘，中老年人突发长期便秘尤其要警惕这类器质性病变。
3. 全身性疾病或外界因素诱发的长期便秘，除了消化道本身的问题，很多其他系统的疾病也会引发长期便秘，比如甲状腺功能减退、糖尿病神经病变、帕金森病、脊髓损伤、慢性肾功能不全等，这些疾病会影响肠道神经或肌肉的正常收缩，减慢肠蠕动；另外长期服用抗抑郁药、部分降压药、阿片类止痛药、钙片等药物，也可能影响肠道功能，引发药源性的长期便秘。