肠易激综合征是不存在肠道器质性病变的功能性肠病，结肠炎是存在肠道炎症损伤的器质性疾病，二者核心区别在于肠道有没有病理性的组织损伤，在多个方面都有明显不同。
1. 本质与病因不同
肠易激综合征说白了就是肠道的功能“乱掉”了，做肠镜、验血都看不到肠道本身有炎症、溃疡这类实打实的损伤，诱因大多和情绪焦虑紧张、饮食不当、受凉、遗传易感性有关，核心问题是胃肠动力异常、内脏感觉过于敏感；结肠炎是肠道本身真的出了病变，肠镜下能直接看到肠黏膜有充血、水肿、糜烂、溃疡这些炎症改变，病因可能是细菌/病毒感染、自身免疫紊乱、长期肠道刺激等等，比如常见的溃疡性结肠炎就和自身免疫异常直接相关。
2. 症状表现不同
肠易激综合征最典型的特点是腹痛、腹部不适，排便之后就能明显缓解，排便习惯改变多是间断腹泻、便秘，或是两者交替，几乎不会出现便血、脓血便、发烧这些症状，也不会导致体重下降、贫血；结肠炎的症状更顽固，炎症活动期会反复排出黏液脓血便，不少患者还会伴随低烧、乏力、消瘦，严重时还可能引发肠出血、肠穿孔这些急症。
3. 治疗与预后不同
肠易激综合征一般不需要抗炎、激素这类特殊治疗，核心是调整生活方式、舒缓情绪，只需要对症用一些缓解痉挛、止泻或者通便的药物改善症状，不会发生**变，预后很好，只是容易因为诱因复发，不会对整体健康造成长期影响；结肠炎需要根据病因针对性治疗，感染性结肠炎要用抗感染药物，溃疡性结肠炎这类炎症性肠病需要长期用药控制炎症，部分病程较长的结肠炎还有一定**变风险，需要定期复查肠镜监测病情。