清理生蚝内脏只需去除蚝体内那团深色的消化腺即可，其余部位都可正常食用，操作不难。
1 预处理开壳：先把带壳生蚝放在清水中浸泡20到30分钟，让外壳缝隙里的泥沙泡松，再用硬毛刷把整个外壳反复刷干净，避免开壳的时候脏东西沾到蚝肉上。接着拿开蚝刀从生蚝壳的闭合缝隙插进去，贴住其中一面壳的内壁切断闭壳肌，撬开外壳就能取出完整的蚝肉。
2 摘除内脏组织：取出蚝肉后，能很清楚看到蚝肉中间偏下位置有一团深黑色（部分海区的生蚝会呈暗绿色）的软团，这就是生蚝的消化内脏，直接用手指捏住这团组织轻轻扯出来，连着的细小黑色肠线也要一起拽掉丢弃。
3 冲洗残留杂质：摘除完内脏后，把蚝肉放到流动的清水下，轻轻搓洗掉附着在表面的内脏碎渣和泥沙，控干水分就可以用来烹饪了。