牡蛎（生牡蛎）和煅牡蛎是同一来源的两种不同炮制药材，二者在炮制方法、功效方向、临床应用上都存在明显区别。
1. 炮制方法不同：生牡蛎就是捕捞后去除牡蛎肉，清洗干净杂质泥沙，直接干燥敲碎制成的原生药材，保留了原药材的全部天然成分属性；煅牡蛎则是将生牡蛎放入耐火容器，经过高温煅烧至质地变酥脆后取出放凉，再碾碎得到的炮制品，高温煅制已经改变了药材的理化性质。
2. 功效侧重不同：生牡蛎偏重于重镇安神、平肝潜阳、软坚散结，核心作用是镇摄浮越的心神、软化消散异常结块；煅牡蛎经过高温煅制后，收敛之性大幅增强，核心功效转为收敛固涩、制酸止痛，原本的重镇安神、软坚散结功效明显减弱。
3. 临床应用不同：生牡蛎临床多用于调理阴虚阳亢引发的头晕头痛、心神不宁导致的失眠惊悸，以及痰瘀郁结类的瘰疬、甲状腺结节、乳腺结节等问题；煅牡蛎多用于治疗自汗盗汗、遗精滑精、崩漏带下这类滑脱不禁的病症，还常用来缓解胃酸过多引起的胃脘灼痛、反酸烧心，外用也可以改善疮疡不敛、反复不愈的湿疹湿疮。