三岁的娃娃肠胃不好可能是由于饮食不当、消化不良、感染等原因引起的。以下是一些建议来帮助调理娃娃的肠胃问题：
1. 饮食调理：确保娃娃的饮食均衡，包括提供充足的蛋白质、蔬菜、水果和全谷物。避免给娃娃吃过多的油腻食物和糖分高的垃圾食品。饮食要细嚼慢咽，不要过量进食。
2. 注意饮水：给娃娃提供充足的水分，有助于改善消化和便秘问题。确保饮水的卫生，是给娃娃煮沸的水或者纯净水。
3. 避免食物过敏：注意观察娃娃对某些食物的过敏反应，如乳制品、麸质、某些水果等。避免给娃娃食用他们过敏的食物。
4. 定期运动：适当的运动有助于促进娃娃的肠胃蠕动，改善消化功能。让娃娃每天进行适当的户外活动或参加适龄的运动。
5. 避免感染：提供良好的卫生环境，避免娃娃接触或食用不洁净的食物和水源，预防感染引起的肠胃问题。
6. 规律作息：保持娃娃的规律作息，确保充足的睡眠时间和休息时间，有助于肠胃的正常功能。
如果娃娃的肠胃问题持续存在或加重，建议咨询儿科医生，进行进一步的诊断和治疗。