新大米发黑是由品种异常、加工不当或变质发霉导致的，除了天然黑色特种稻之外，其余情况的发黑新大米都不建议食用。
1. 加工环节出问题导致。新收割稻谷如果收割期遇连阴雨，没能充分晾晒脱水，水分含量超标的稻谷脱壳时，更容易被破碎的稻壳、糠粉污染，糠屑附着在米粒表面就会让大米整体发暗发黑；另外一些小型加工作坊设备老旧，筛分不***，也会让杂质残留在米粒上，造成发黑发暗的观感。
2. 储存不当发霉变质导致。新稻谷收割后如果水分没降到安全存储标准，堆放或存储过程中，温度湿度条件合适就会快速滋生霉菌，霉菌代谢过程中会产生带色素的分泌物，就会让米粒变成灰黑色。这种发黑的大米已经变质，还可能携带致**的黄曲霉素，绝对不能食用。
3. 品种或种植污染导致。天然的特种深色稻米比如黑香米，本身米粒就是接近黑色的深褐色，不少不熟悉的人会把新鲜黑大米当成普通大米误以为是发黑变质，这种天然发黑的大米颗粒均匀，刮掉外层麸皮后内部还是米白色，和变质发黑很好区分；另外如果稻田被重金属、污染物污染，长出的新大米也会出现异常发黑，这种同样不建议食用。