肠道菌群是人体肠道内由万亿微生物构成的复杂生态系统，涵盖细菌、真菌及病毒等。这些微生物通过分解膳食纤维产生短链脂肪酸（SCFA），如乙酸、丙酸和丁酸，不仅能作为结肠细胞能量来源，还可通过激活G蛋白偶联受体调节免疫功能，抑制炎症反应。双歧杆菌等益生菌更可分解乳糖，缓解乳糖不耐受症状。
代谢物是菌群与宿主互作的核心媒介。色氨酸经肠道菌群代谢生成的吲哚类物质，可通过激活芳烃受体调控肠道屏障功能；胆碱代谢产生的三甲胺（TMA）在肝脏转化为氧化三甲胺（TMAO），与动脉粥样硬化风险直接相关。而菌群合成的B族维生素，如叶酸和维生素K，其产量甚至超过日常饮食摄入量，成为人体必需营养的重要补充。
菌群失衡会引发连锁反应。肥胖患者肠道中厚壁菌门比例升高，拟杆菌门减少，导致能量吸收效率异常；糖尿病患者体内支链氨基酸水平上升，与胰岛素抵抗密切相关。通过补充特定菌株或摄入益生元，可重建菌群平衡，例如阿克曼菌能改善胰岛素敏感性，双歧杆菌组合可预防抗生素相关性腹泻。
维护菌群健康需从饮食、生活习惯入手。每日摄入30克膳食纤维，搭配酸奶、泡菜等发酵食品，可促进有益菌增殖；避免滥用抗生素，适度运动与规律作息则能增强菌群稳定性。当出现持续腹胀、便秘等症状时，及时就医评估菌群状态，已成为现代健康管理的重要环节。